月餅的餅餡一般分為軟硬兩種，軟餡中含水分較多，只能保存7到10天左右，而硬餡月餅則可保存1個月左右。盒裝月餅，應將盒蓋打開，使其通風。另外，因月餅中含脂肪較多，存放時還應注意避光，以防油脂氧化。

月餅要輕拿輕放，尤其是蘇式月餅因皮酥松，最容易破碎。如果餅皮脫落，不僅影響外觀，而且影響口味、質量，并且易受潮變質。

月餅含有豐富的油脂和糖分，受熱受潮都極易發霉、變質，所以一定要將月餅存放在低溫、陰涼、通風的地方。目前，市場上月餅的保質期一般在45-60天左右。月餅的保存條件，當氣溫超過30℃，未經過單粒包裝的月餅存放時間一般不宜超過7天;在25℃的氣溫環境下，杏仁、百果等餡心月餅可存放15天左右;豆沙、蓮蓉、棗泥等餡心月餅，存放時間則不宜超過10天;至于鮮肉、雞絲、火腿等月餅，應隨買隨吃。

月餅存放時，不宜與其他食品、雜物放在一起，以免串味，失去應有的口味和特色。存放期間還要注意防止蟑螂、螞蟻、老鼠等侵食，以防傳染疾病。

專家認為，如果家里的月餅兩三天內能吃完，室溫保存即可。一時食用不完時，可采用以下方法保存：將月餅放進潔凈的食品袋內放入冰箱的保鮮柜內儲存;硬式月餅可放入紙盒內儲存，可保存十來天不變壞。最好不要冷凍月餅，月餅冷凍后口感會發生變化。